Roche cobas s 201 system Používateľská príručka

0

Systém cobas s 201 0

Referenční příručka pro hardware

a software 0

P/N: 05042062041-01

0.2 03/2007, verze 1.0

Tato příručka je určena pro použití se softwarem AMPLILINK verze 3.1.2. nebo vyšší.

Tato příručka není určena pro použití u aplikací prováděných za použití verzí

softwaru AMPLILINK nižšími než 3.1.2.

Předmluva

03/2007, verze 1.0 0.3

Obsah

Předmluva

Obsah ..................................................................................................0.3

Historie revizí .....................................................................................0.6

Jak používat tuto příručku ................................................................0.8

Konvence používané v této příručce ...............................................0.9

Slovníček pojmů ..............................................................................0.14

Bezpečnostní opatření .....................................................................0.25

1. Úvod

Účel použití ........................................................................................1.1

Součásti systému ................................................................................1.2

2. Přehled hardwaru

Přístroje ...............................................................................................2.2

Uzel serveru PDM .............................................................................2.2

Pracovní stanice řízení tvorby směsi ...............................................2.3

Pracovní stanice Data Management pro řízení dat .......................2.5

Datová stanice pro software AMPLILINK .....................................2.6

Sestava pro zálohování k serveru .....................................................2.7

Tiskárna ..............................................................................................2.7

LIS ........................................................................................................2.7

Kontrola komunikace .......................................................................2.8

Pravidla pro použití počítače a sítě .................................................2.9

3. Pipetor Hamilton Microlab STAR IVD / STARlet IVD

Přehled ................................................................................................3.1

Specifikace ..........................................................................................3.2

Instalace ..............................................................................................3.3

Podavač ...............................................................................................3.7

Spotřební materiál pro přípravu směsí .........................................3.20

Vyprazdňování pipetoru ................................................................3.24

Řešení potíží .....................................................................................3.26

4. Zařízení COBAS

®

AmpliPrep

Přehled ................................................................................................4.1

Specifikace ..........................................................................................4.1

Instalace ..............................................................................................4.3

Metodologie ........................................................................................4.8

Hlavní kryt ..........................................................................................4.9

Plnicí panel .......................................................................................4.11

Servisní panel ...................................................................................4.11

Hlavní vypínač (On/Off) ................................................................4.12

Lišta kontrolek .................................................................................4.13

Přehled pracovní oblasti .................................................................4.15

Filtry ..................................................................................................4.17

Promývací šachty na špičky na činidlo .........................................4.17

Platforma stojanu ............................................................................4.18

Kazety s činidlem .............................................................................4.19

Stojany na činidla ............................................................................4.20

Stojany SK 24 ....................................................................................4.21

0.4 03/2007, verze 1.0

Snímač čárového kódu ....................................................................4.21

Inicializační sloupky ........................................................................4.22

Jednotka na zpracování vzorku (SPU) ..........................................4.23

Stojany SPU ......................................................................................4.25

Inkubátory na zpracování vzorků .................................................4.26

Inkubátor pro uvolnění cíle ............................................................4.27

Výstupní platforma .........................................................................4.28

Separační stanice ..............................................................................4.29

Přenosová ramena ...........................................................................4.30

Nastavení a obsluha .........................................................................4.31

Odstranění použitého spotřebního materiálu .............................4.31

Nepřetržitý provoz ..........................................................................4.32

Zastavení zařízení v průběhu cyklu ...............................................4.35

Řešení chyb .......................................................................................4.36

5. Analyzátor COBAS

®

TaqMan

®

Přehled ................................................................................................5.1

Specifikace ..........................................................................................5.2

Instalace ..............................................................................................5.3

Metodologie ........................................................................................5.7

Hlavní kryt ..........................................................................................5.8

Panely ................................................................................................5.10

Hlavní vypínač (On/Off) ................................................................5.11

Lišta kontrolek .................................................................................5.12

Pracovní oblast .................................................................................5.13

Přenosová hlava ...............................................................................5.14

Odpadní stanice ...............................................................................5.15

Parkovací pozice K-nosičů .............................................................5.16

Systém termocykleru .......................................................................5.17

Fluorometrický systém ...................................................................5.18

Inicializační sloupky ........................................................................5.19

Oblast pro vkládání stojanů SK24 .................................................5.19

Snímač čárového kódu ....................................................................5.20

Nastavení a obsluha .........................................................................5.20

Odstranění použitého spotřebního materiálu .............................5.21

Zastavení analyzátoru během cyklu ..............................................5.22

Řešení chyb .......................................................................................5.23

6. Přehled softwaru PDM Roche

Přehled ................................................................................................6.1

Služba přihlášení ................................................................................6.3

Elektronický podpis ...........................................................................6.6

Rozvržení obrazovky .........................................................................6.7

Třídění a úprava velikosti sloupců ................................................6.10

Vytváření zpráv ................................................................................6.11

7. Průvodce tvorbou směsi – Roche PDM Pooling Wizard

Záložka Pooling (tvorba směsi) .......................................................7.2

Přerušení cyklu pipetování .............................................................7.12

Záložka Instrument .........................................................................7.14

Řešení chyb .......................................................................................7.15

Předmluva

03/2007, verze 1.0 0.5

8. Software pro řízení tvorby směsi –

Software Roche PDM Pooling Manager

Přehled ................................................................................................8.1

Záložka Query ....................................................................................8.4

Záložka Details ...................................................................................8.7

Záložka Worklist .............................................................................8.26

Záložka Trace ...................................................................................8.30

Config Tab ........................................................................................8.30

Zprávy o tvorbě směsi .....................................................................8.31

9. Software pro řízení dat – Roche PDM Data Manager

Přehled ................................................................................................9.1

Záložka Review Batches ....................................................................9.4

Záložka Query ....................................................................................9.7

Záložka Details .................................................................................9.10

Záložka Worklist .............................................................................9.34

Záložka UDEC .................................................................................9.42

Záložka Exclude Donors .................................................................9.42

Zprávy v aplikaci Data Manager ....................................................9.44

10. Software AMPLILINK

Přehled ..............................................................................................10.1

Okno Messages ..............................................................................10.16

Okno Overview .............................................................................10.22

Okno Systems .................................................................................10.25

Okno Orders ..................................................................................10.53

Okno Results ..................................................................................10.62

Příznaky ..........................................................................................10.64

Vnitřní příznaky ............................................................................10.67

Okno Configuration ......................................................................10.72

Okno Memo Pad ...........................................................................10.79

11. Údržba

Protokoly o údržbě ..........................................................................11.1

Pipetor Hamilton Microlab STAR IVD / STARlet IVD ............11.3

Zařízení COBAS

®

AmpliPrep ........................................................11.8

Analyzátor COBAS

®

TaqMan

®

...................................................11.26

12. Hlášení

Software Roche PDM a pipetor Hamilton Microlab

STAR IVD / STARlet IVD .............................................................12.1

Software AMPLILINK ..................................................................12.33

Zařízení COBAS

®

AmpliPrep ......................................................12.45

Analyzátor COBAS

®

TaqMan

®

...................................................12.55

13. Rejstřík

0.6 03/2007, verze 1.0

Historie revizí

Revize příručky Datum revize

1.0 Březen 2007

Roche Molecular Systems, Inc.

Branchburg, NJ

USA

Distributed by

Roche Diagnostics

Indianapolis, IN 46256 USA

(For Technical Assistance call the

Roche Response Center

toll-free 1-800 526 1247)

Roche Diagnostics

H7V 4A2 Laval, Quebec

(For Technical Assistance call:

Pour toute assistance technique,

appeler le: 1-877 273 3433)

Roche Diagnostics (Schweiz) AG

CH-6343 Rotkreuz

Roche Diagnostics

F-38240 Meylan

Roche Diagnostics GmbH

D-68298 Mannheim, Germany

Distributore in Italia:

Roche Diagnostics SpA

Piazza Durante 11

I-20131 Milano

Roche Diagnostics S.L.

E-08006 Barcelona

Distribuidor em Portugal:

Roche Farmacêutica Química, Lda

P-2700 Amadora

Prohlášení o shodě

Systém cobas s 201 se skládá z následujících jednotlivých součástí, přičemž každá z nich

splňuje požadavky směrnice 98/79/EC Evropského parlamentu a Rady z 27. října 1998

o lékařských přístrojích pro in-vitro diagnostiku. Splnění podmínek je doloženo

prostřednictvím následujících jednotlivých prohlášení o shodě:

l

Pooling and Data Management

(PDM)

Roche Molecular Systems, Inc.

Branchburg, NJ

USA

l

Pipetor Hamilton Microlab

STAR IVD / STARlet IVD

Hamilton Company

Bonaduz

Švýcarsko

l

Zařízení COBAS

®

AmpliPrep

Roche Diagnostics Ltd.

CH-6343 Rotkreuz

Švýcarsko

l

Analyzátor COBAS

®

TaqMan

®

Roche Diagnostics Ltd.

CH-6343 Rotkreuz

Švýcarsko

Předmluva

03/2007, verze 1.0 0.7

S otázkami nebo komentáři k obsahu této příručky se můžete obrátit na

vašeho zástupce společnosti Roche nebo je můžete zaslat na adresu:

Roche Molecular Systems, Inc.

4300 Hacienda Drive

Pleasanton, California 94588-2722

ROCHE, AMPERASE, AMPLILINK, COBAS, AMPLIPREP a TAQMAN

jsou obchodní značky společnosti Roche.

ROCHE RESPONSE CENTER je servisní značka společnosti Roche.

HP a StorageWorks jsou ochranné známky společnosti Hewlett-Packard

ve Spojených státech amerických, případně v dalších zemích.

Microlab je registrovaná obchodní známka společnosti Hamilton.

Microsoft, Windows a Windows XP jsou buď registrované obchodní

známky nebo obchodní známky společnosti Microsoft Corporation ve

Spojených státech a/nebo jiných zemích.

Oracle je registrovaná ochranná známka společnosti Oracle.

Software AMPLILINK:

Verze zdrojového kódu softwaru („software“) je dostupná na základě

smluvních podmínek veřejné licence Interbase verze 1.0. Uživatel může

získat kopii licence na adrese:

http://interbase.com/IPL.html.

Software je nabízen výhradně podle smluvních podmínek veřejné licence

Interbase verze 1.0.

0.8 03/2007, verze 1.0

Jak používat tuto příručku

Před prací se systémem cobas s 201 je důležité, aby si uživatel prostudoval

všechna varování, upozornění a bezpečnostní požadavky v této příručce

a porozuměl jim.

Symboly varování, upozornění a bezpečnostních opatření, použité v této

příručce, jsou popsány v části Symboly na straně 0.10.

Předmluva (Předmluva) shrnuje bezpečnostní opatření, nezbytná při

instalaci, provozu a servisu tohoto systému.

Kapitola 1 (Úvod) popisuje účel použití systému cobas s 201

apředstavuje součásti systému.

Kapitola 2 (Přehled hardwaru) obsahuje schéma sítě a popisuje

periferní hardwarová zařízení.

Kapitola 3 (Pipetor Hamilton Microlab STAR IVD / STARlet

IVD)

popisuje hlavní součásti pipetoru Hamilton Microlab

STAR IVD / STARlet a spotřební materiál pro pipetování.

Kapitola 4 (Zařízení COBAS

®

AmpliPrep) popisuje hlavní součásti

přístroje COBAS

®

AmpliPrep a spotřební materiál pro

extrakci.

Kapitola 5 (Analyzátor COBAS

®

TaqMan

®

) popisuje hlavní součásti

analyzátoru COBAS

®

TaqMan

®

.

Kapitola 6 (Přehled softwaru PDM) poskytuje popis veškerých

součástí softwaru PDM softwaru a popisuje běžné funkce.

Kapitola 7 (Průvodce tvorbou směsi – Roche PDM Pooling Wizard)

popisuje použití průvodce tvorbou směsi Roche PDM

Pooling Wizard určeného k obsluze pipetoru Hamilton

Microlab STAR IVD / STARlet

IVD.

Kapitola 8 (Software pro řízení tvorby směsi – Roche PDM Pooling

Manager) popisuje použití softwaru pro řízení tvorby

směsi Roche PDM Pooling Manager určeného k řízení

operací při tvorbě směsi.

Kapitola 9 (Software pro řízení dat – Roche PDM Data Manager)

popisuje použití softwaru pro řízení dat Roche PDM Data

Manager určeného pro kontrolu a vydávání výsledků dárců.

Kapitola 10 (Software AMPLILINK) popisuje softwarovou aplikaci

AMPLILINK, uspořádání hlavní obrazovky, nabídek

anástrojů.

Kapitola 11 (Údržba) podává přehled o krocích nutných pro pravidelný

servis pipetoru Hamilton Microlab STAR IVD / STARlet,

zařízení COBAS

®

AmpliPrep a analyzátoru COBAS

®

Taq Man

®

.

Kapitola 12 (Hlášení) poskytuje informace o hlášeních, která mohou

být zobrazena při provozu systému.

Rejstřík

Předmluva

03/2007, verze 1.0 0.9

Konvence používané v této příručce

Textové konvence V příručce použity určité textové konvence pro rychlé a konzistentní

poskytnutí informací. Používají se následující textové konvence:

Textová konvence Použití

Číslované seznamy Číslované postupy, které je třeba při práci

provést v uvedeném pořadí:

1. Zobrazte záložku Donor Review.

2. Zvolte požadovaný filtr stavu.

Tučné písmo Zdůraznění popisovaného pojmu nebo

komponenty:

Archivní plotna se používá pro uchování

vzorků pro pozdější testování.

Kurzíva Označuje jinou část této příručky, kterou

byste si měli přečíst, nebo označuje název

obrazovky.

Symboly varování jsou popsány v kapitole

Symboly na straně 0.10.

> Rozděluje volby příkazu ve víceúrovňovém

příkazu:

Z nabídkové lišty zvolte File > Shut Down.

0.10 03/2007, verze 1.0

Symboly

Určité symboly použité v této příručce jsou určeny pro rychlou vizuální

orientaci. Jsou to tyto symboly:

Symbol Použití

Informativní poznámka. Označuje

poznámku, která poskytuje doplňkové

informace k aktuálnímu tématu nebo postupu.

Důležitá poznámka. Označuje důležitou

poznámku, kterou je třeba posoudit

apochopit.

Varov ání. Označuje potenciálně nebezpečnou

situaci, která by mohla způsobit smrt nebo

závažné poškození zdraví, pokud by se jí

nezabránilo.

Pozor. Označuje potenciálně nebezpečnou

situaci, která by mohla způsobit úraz a/nebo

poškození systému, pokud by se jí nezabránilo.

Pozor pohyblivé součásti. Označuje

potenciálně nebezpečnou situaci. Nedotýkejte

se pohyblivých součástí.

Pozor horký povrch. Označuje přítomnost

horkého povrchu. Nedotýkejte se horkých

povrchů.

Pozor laserový vysílač. Označuje přítomnost

laserového vysílače. Nedívejte se do laserového

vysílače.

Pozor potenciálně biologicky nebezpečný

materiál. Označuje potenciálně nebezpečnou

situaci, způsobenou biologicky nebezpečným

materiálem, která by mohla způsobit smrt

nebo závažné poškození zdraví.

Předmluva

03/2007, verze 1.0 0.11

Na typovém štítku systému jsou uvedeny tyto symboly:

Elektrická a elektronická zařízení označená

tímto symbolem jsou uvedená v evropské

směrnici OEEZ (WEEE). Tento symbol

znamená, že zařízení se nesmí likvidovat

vkomunálním odpadu.

Směrnice Evropského parlamentu a Rady

2002/96/ES ze dne 27. ledna 2003

o odpadních elektrických a elektronických

zařízeních (OEEZ).

Symbol Použití

Pozor: Přečtěte si průvodní dokumentaci.

Trojúhelníkový symbol na zadní straně

přístroje je obecnou upomínkou, aby si

uživatelé přečetli bezpečnostní informace, které

jsou uvedeny v této příručce. Uživatelé musí být

schopni identifikovat specifická rizika

a vhodným způsobem jim zabránit.

Výrobce zařízení.

0.12 03/2007, verze 1.0

Na pipetoru Hamilton Microlab STAR IVD / STARlet IVD jsou tyto

symboly:

Na zařízení COBAS

®

AmpliPrep jsou následující symboly:

Pozor laserový vysílač. Nachází se na čtečce

čárového kódu a upozorňuje na přítomnost

laserového vysílače. Nedívejte se do

laserového vysílače.

Pozor. Nachází se na klapkách a označuje

potenciálně nebezpečnou situaci. Nechte

klapky vysunuté, aby nedošlo k nárazu do

podavače.

Pozor. Nachází se pravé straně krytu a na

ramenu pipetoru. Označuje potenciálně

nebezpečnou situaci. Nedotýkejte se

pohyblivých součástí.

Pozor potenciálně biologicky nebezpečný

materiál. Nachází se na levé straně krytu a na

pravé straně pipetoru. Označuje, že vzorky

dárců a sáček na odpad mohou obsahovat

biologicky nebezpečný materiál.

Pozor laserový vysílač. Nachází se na

přenosové hlavě 1 a upozorňuje na

přítomnost laserového vysílače. Nedívejte se

do laserového vysílače.

IEC 825-1: 1993

Class 1 Laser Product

Appareil à laser de classe 1

1550 nm < 10 mW

Pozor. Je umístěný za plnícím panelem

a označuje typ použitého laseru. Nedívejte se

do laserového vysílače.

Warning – Fire Hazard

For continued protection

replace only with same

type and rating of fuse.

Varování. Nachází se pod zdrojem napájení.

Vyměňte pojistku pouze za pojistku stejného

typu a hodnoty.

Předmluva

03/2007, verze 1.0 0.13

Na analyzátoru COBAS

®

TaqMan

®

jsou následující symboly:

Pozor potenciálně biologicky nebezpečný

materiál. Nachází se za plnícím panelem, na

levé straně zařízení a značí, že K-zkumavky,

S-zkumavky a jednotky SPU mohou

obsahovat biologicky nebezpečný materiál.

Pozor laserový vysílač. Nachází se na

snímači čárového kódu a upozorňuje na

přítomnost laserového vysílače. Nedívejte

se do laserového vysílače.

Pozor pohyblivé součásti

. Nachází se na

každém termocykleru a označuje potenciáoně

nebezpečnou situaci. Nedotýkejte se

pohyblivých součástí.

Pozor horký povrch. Nachází se na každém

termocykleru a označuje přítomnost

horkého povrchu. Nedotýkejte se horkých

povrchů.

Pozor biologické riziko. Je umístěn za

plnicím panelem a na servisním panelu.

Označuje, že K zkumavky mohou obsahovat

biologicky nebezpečný materiál.

0.14 03/2007, verze 1.0

Slovníček pojmů

Terminologie použitá u systému cobas s 201 je obecně stejná jako

terminologie, která se používá v klinických laboratořích. Pro popis

postupu nebo komponenty se však používají určité specifické pojmy.

Přehled těchto pojmů a jejich definicí je uveden níže.

2D tvorba směsi

Dvourozměrná tvorba směsi. Sekundární

tvorba směsi

na reaktivní nebo neplatné

primární směsi s velkým počtem vzorků,

která vytváří

matici směsí vzorků dárců, kde

je každý vzorek dárce pipetován do

jednoznačné sady dvou samostatných směsí,

a pokud jsou tyto dvě směsi reaktivní,

výsledky mohou být přiřazeny k příslušnému

vzorku dárce.

AFI Absolutní zvýšení fluorescence.

AmpErase Enzym AmpErase (uracil-N-glykosyláza) je

obsažen v činidle Master Mix pro selektivní

destrukci kontaminujících produktů

(obsahujících deoxyuridin) z předchozích

amplifikačních reakcí.

Amplifikace Proces produkce mnoha kopií DNA z jednoho

vzoru DNA nebo RNA cílového regionu.

Kamplifikaci na analyzátoru COBAS

®

TaqMan

®

dojde tehdy, když se extrahované

vzorky zahřejí a zchladí v termocyklerech

podle údajů v profilu polymerázové řetězové

reakce (PCR) pro zvolený test.

Archivní plotna Plotna s 12 x 8 hlubokými jamkami, která se

používá k uchování alikvotních podílů vzorků

dárců pro případ, že test je nutné opakovat.

CAN Kanada.

CFR Code of Federal Regulations (CFR) je soubor

psaných norem publikovaných ve federálním

registru ministerstvy a výkonnými orgány

federální vlády Spojených států. CFR je

rozdělen do 50 titulů, které představují široké

oblasti podléhající federálním předpisům.

Předmluva

03/2007, verze 1.0 0.15

cLLD Kapacitní LLD – detekce hladiny kapaliny na

základě objemu

CSA Kanadská společnost pro standardy.

Cyklus plotny Druhý krok v procesu primární tvorby směsi

pro směsi s velkým počtem vzorků.

V jamkách přechodné plotny se vytvoří

přechodné směsi, každá obsahuje alikvotní

podíly 12 vzorků dárců. V implicitní

konfiguraci připravuje systém cobas s 201

také archivní plotnu, která slouží k uložení

alikvotního podílu z každé zkumavky se

vzorkem dárce pro případ, že je nutný

další test.

Cyklus zpracování

dávky

Druhý krok v procesu primární tvorby směsi

pro směsi s velkým počtem vzorků.

Napipetují se kontroly a poté se stejné

alikvotní podíly z jamek přechodné plotny

přenesou do S-zkumavek a vytvoří se směsi

s 24 (dvě jamky), 48 (čtyři jamky) nebo 96

(osm jamek) vzorky.

Definiční soubor

testu

Soubor obsahující všechny procesní kroky

nezbytné pro přípravu vzorku, amplifikaci

a detekci. Definiční soubory testu jsou

poskytovány společností Roche na

CD-ROMu a jsou zaváděny do softwaru

AMPLILINK.

Denaturace Biochemický proces separace dvouvláknové

DNA na jednotlivá vlákna přerušením

vodíkových vazeb zvyšováním teploty.

Detekce Získání výsledků měření, které slouží ke

stanovení reaktivity vzorku na cílový analyt.

Během amplifikace se fluorescence měří při

zvolených teplotách a časech. Po dokončení

testu software AMPLILINK analyzuje

kompletní data a stanoví přítomnost

amplifikovaných produktů na základě

sekvencí cílové nukleové kyseliny a vnitřní

kontroly.

0.16 03/2007, verze 1.0

DNA Deoxyribonukleová kyselina (DNA) je

genetický materiál, který se předává

z mateřských do dceřiných buněk a přenáší

charakteristické druhové vlastnosti ve formě

genů, které obsahuje a proteinů, jejichž

složení kóduje. Stavebními kameny syntézy

nového řetězce DNA jsou následující čtyři

nukleotidtrifosfáty: dATP, dCTP, dTTP

adGTP.

Doba opakovaného

použití

Časové období, které musí uplynout po

obdržení konečných výsledků zkumavky

dárce, aby bylo možné ID čárového kódu opět

použít.

Dorazový kolík pro

pipetovací špičky

Dorazový kolík pipetovací špičky je umístěn

na konci každého pipetovacího kanálu.

Dorazový kolík pipety vyrovnává

jednorázovou pipetovací špičku poté, co je

zachycena pipetovacím kanálem na začátku

pipetovacího cyklu.

Časový limit realizace Uplynulý čas mezi počátečním pipetováním

a přiřazením konečných výsledků.

Není-li výsledek přijat v časovém limitu

realizovatelnosti, je vzorku automaticky

přiřazen status Kompletní, nejasný, pokud

není vzorek vyhodnocen jako reaktivní

v individuální směsi (primární směs s

1 vzorkem nebo směs pro rozlišení).

V takovém případě je vzorku automaticky

přiřazen status Kompletní, reaktivní.

EN Evropská norma.

Extrakce Proces izolace DNA nebo RNA pro následnou

molekulární analýzu. Extrakce se provádí na

směsi vzorků na zařízení COBAS

®

AmpliPrep.

Hodnota ohybu viz Prahový cyklus.

IC Viz vnitřní kontrola.

Předmluva

03/2007, verze 1.0 0.17

IEC Mezinárodní elektrotechnická komise.

Mezinárodní orgán pro standardy a hodnocení

shody pro všechna elektrotechnologická

odvětví.

Jednotka pro zpracování

vzorku

Prostředek na jedno použití, který obsahuje

směs vzorku a činidla během přípravy vzorku.

SPU se skládá ze dvou procesních komůrek,

komůrky na odpad a komůrky pro špičku na

vzorek.

Jedna SPU se používá pro každý zpracovávaný

vzorek.

Klinický vzorek Jedná se o vzorek od dárce.

K-nosič Kovový držák určený k opakovanému použití,

do kterého je možné umístit až 24 K-zkumavek,

které obsahují vzorky připravené k PCR pro

analýzu v analyzátoru COBAS

®

TaqMan

®

.

Kontrolní jehly Osm titanových pipetovacích špiček, které se

používají k automatické kontrole (a v případě

potřeby k seřízení) polohy každého

pipetovacího kanálu. Kontrolní jehly jsou

umístěny zcela vzadu v odpadní stanici, vedle

sáčku na odpadní špičky.

K-špička Kinetická špička. Špička na jedno použití,

která se používá pro resuspendování a přenos

připraveného vzorku do K-zkumavky.

K-zkumavka Kinetická zkumavka. Zkumavka

k jednorázovému použití, která se používá

k amplifikaci připraveného vzorku s Master

Mix. K-zkumavky jsou dodávány předem

naplněné v zakrytém stojanu K-zkumavek.

LAN Local Area Network (Lokální sít’)

LED Svítivá dioda.

0.18 03/2007, verze 1.0

LIS Laboratorní informační systém. Počítačový

systém pro zadávání, zpracování a hlášení

laboratorních informací. Informace zahrnují,

mimo jiné, demografické údaje dárce, data

testu a soupis spotřebního materiálu.

LLD Detekce hladiny kapaliny.

Magnetické skleněné

částice

Malé magnetické částice suspendované

v kapalině, které se v kombinaci s dalšími

činidly váží na nukleové kyseliny díky

kladnému náboji na povrchu a umožňují

oddělení nukleových kyselin od dalších

komponent vzorku pomocí magnetu

vprůběhu promývání.

MGP viz Magnetické skleněné částice.

MPX Multiplexní sada cílů, která může zahrnovat

HCV, HIV-1 skupiny M, HIV-1 skupiny O,

HIV-2 a HBV.

Neúplná směs Neúplná směs je primární směs, která

obsahuje méně vzorků než plánovaných 96,

48 nebo 24. Neúplná směs vzniká následkem

chyb(y) při pipetování během tvorby

primárních směsí s velkým počtem vzorků.

Nosič plotny Opakovaně použitelný nosič se používá ke

vložení až pěti ploten do pipetoru a jejich

vyjmutí z pipetoru

Hamilton Microlab

STAR

IVD / STARlet IVD.

Nosič špiček Nosič se používá ke vložení až pěti stojanů

špiček do pipetoru a jejich vyjmutí z pipetoru

Hamilton Microlab STAR IVD / STARlet

IVD.

Nosič S-zkumavek Nosič k opakovanému použití se používá ke

vložení stojanů SK24 do pipetoru a jejich

vyjmutí z pipetoru Hamilton Microlab STAR

IVD / STARlet IVD.

Předmluva

03/2007, verze 1.0 0.19

Nosič zkumavek

dárců

Opakovaně použitelný nosič se používá ke

vložení zkumavek se vzorky dárců do

pipetoru a jejich vyjmutí z pipetoru Hamilton

Microlab STAR IVD / STARlet IVD.

Nosič zkumavky

kontroly

Nosič k opakovanému použití se používá ke

vložení stojanů zkumavek RMEC do pipetoru

a jejich vyjmutí z pipetoru Hamilton Microlab

STAR IVD / STARlet IVD.

Opakovaná tvorba

směsi

Směs připravená smísením stejných

alikvotních podílů buď ze zkumavek dárců

nebo z archivní plotny, která slouží

k opětnému testu primární směsi, jejíž

výsledky testu byly neplatné.

Opakovaný cyklus Druhý krok cyklu primární tvorby směsi je

zopakován pro opakované testování vzorků

dárců ze směsí s neplatnými výsledky testů.

PCR Polymerázová řetězová reakce. In vitro

biochemický proces používaný pro amplifikaci

krátkých specifických sekvencí cílové nukleové

kyseliny. PCR je uskutečňována teplotními

cykly amplifikační směsi dle nastaveného

profilu. Profil se obecně skládá z 1) denaturace,

2) renaturace (annealingu) a 3) polymerace.

PDM Správa tvorby směsí a dat – Pooling and Data

Management (PDM)

pLLD Tlaková detekce hladiny kapaliny.

Plotna s hlubokými

jamkami

Archivní plotna nebo přechodná plotna.

Přechodná plotna Plotna s hlubokými jamkami 12 x 8, která se

používá ke tvorbě dočasných směsí během

první fáze primární tvorby směsi pro směsi

s velkým počtem vzorků.

Prahový cyklus Cyklus amplifikace / detekce, kdy růstová

křivka překračuje specifickou úroveň

fluorescence a lze sledovat rychlost růstu.

0.20 03/2007, verze 1.0

Primární směs Směs připravená smísením stejných

alikvotních podílů ze stanoveného počtu

zkumavek dárců do jedné S-zkumavky. Po

úspěšném nasátí vzorku v systému již není

tento vzorek způsobilý pro tvorbu primárních

směsí.

Prodloužení Jedná se o biologický proces prodloužení

řetězce DNA, který je syntetizován DNA

polymerázou s použitím vlákna mateřské

DNA, která slouží jako šablona pro syntézu

dceřiného vlákna.

RDBMS Systém řízení relační databáze.

Renaturace (annealing) Biochemický proces hybridizace nebo vázání

dvou segmentů komplementární nukleové

kyseliny snížením teploty.

RF Vysokofrekvenční kmitočet.

RFI Relativní zvýšení fluorescence.

RMEC Externí kontrola vyrobená společností Roche.

RMEC jsou povinné pro každou dávku.

RT Reverzní transkripce. Generuje kopii vlákna

RNA, ale tato kopie je komplementárním

vláknem DNA (cDNA), které pak může

podstoupit PCR amplifikaci. Protože je RNA

neefektivním substrátem pro Taq DNA

polymerázu, tak je nezbytné provádět

reverzní transkripci před inicializací PCR

amplifikace při analýze virové RNA.

Sekundární tvorba

směsi

Následná tvorba směsi, která slouží ke

vyřešení neplatných nebo reaktivních

prvotních výsledků testu.

Směs pro rozlišení Směs připravená z jednoho vzorku buď ze

zkumavek dárců nebo archivní plotny, která

slouží k opětnému testu vzorků, které buď

byly reaktivní nebo byly jejich výsledky

neplatné.

Stránka sa načítava...

Roche cobas s 201 system Používateľská príručka

Súvisiace články

Ostatné dokumenty