Roche cobas s 201 system Používateľská príručka
- Typ
- Používateľská príručka
02/2007, verze 1.0 2.1
Pipetování 2
Koncepce práce s dávkami
Systém cobas s 201 je určen pro zpracování vzorků v dávkách. Dávka je
soubor vzorků a kontrol, které se pipetují, extrahují, amplifikují a detekují
společně podle pravidel ve specifikaci k příslušnému testu.
Dávku tvoří všechny vzorky a kontroly v jednom stojanu SK24.
Dávka se sleduje od tvorby směsi až k vyhodnocení výsledků pomocí ID
stojanu SK24 a jednoznačného ID dávky přiřazeného během pipetování.
Vzorky a kontroly v dávce se sledují pomocí propojení jejich snímaného
ID čárového kódu s jednoznačnými klipy s čárovým kódem, které drží
S-zkumavky (během tvorby směsi a přípravy vzorku) a K-zkumavky
(během amplifikace a detekce).
Obrázek 2.1
Dávka
ID stojanu SK24
Jednoznačný klip
s čárovým kódem S-zkumavky
2.2 02/2007, verze 1.0
Externí kontroly vyrobené společností Roche
(RMEC)
Každá dávka vyžaduje externí kontroly vyrobené společností Roche
(RMEC). Počet požadovaných RMEC závisí na testu.
Test MPX zahrnuje pět analytů. Pro každou dávku se musí pipetovat pět
pozitivních RMEC a jedna negativní RMEC. Během pipetování se alikvotní
podíl negativní kontroly přenese do S-zkumavky na pozici 19 každého
stojanu SK24. Poté se alikvotní podíly každé pozitivní kontroly přenesou do
S-zkumavek na pozice 20 až 24 každého stojanu SK24 (Obrázek 2.2).
Test WNV zahrnuje jediný analyt. Pro každou dávku se musí pipetovat jedna
negativní RMEC a jedna pozitivní RMEC. Během pipetování se alikvotní
podíl negativní kontroly přenese do S-zkumavky na pozici 23 každého
stojanu SK24. Poté se alikvotní podíl pozitivní kontroly smísí s druhým
alikvotním podílem negativní kontroly (získané z druhé zkumavky negativní
kontroly sloužící k ředění pozitivní kontroly) v S-zkumavce na pozici 24
každého stojanu SK24. (Obrázek 2.3).
K pipetování RMEC dochází vždy před pipetováním vzorků. Díky
tomu může operátor ještě před začátkem pipetování vzorků opravit
veškeré chyby při pipetování kontrol.
RMEC se vkládají do posledních pozic každého stojanu SK24, takže
celý proces testování, od přípravy vzorků až po amplifikaci a detekci,
je monitorován pomocí kontrolních vzorků.
Obrázek 2.2
RMEC testu MPX ve stojanu SK24
Negativní
kontrola
Pozitivní
kontroly
Obrázek 2.3
RMEC testu WNV ve stojanu SK24
Pozitivní
kontrola
Negativní
kontrola
Pipetování
02/2007, verze 1.0 2.3
Externí kontroly definované uživatelem
(UDEC)
Systém cobas s 201 umožňuje přiřadit každému testu až pět externích
kontrol definovaných uživatelem (UDEC). Požadavky na UDEC, včetně
názvu kontroly, vzoru čárového kódu, čísla šarže, data použitelnosti
a pozice UDEC ve stojanu SK24 specifikuje správce laboratoře.
Když jsou UDEC přiřazeny k určitému testu, může operátor určit, zda je
zařadí do běhu pipetování.
Jestliže je zařadí, UDEC se vždy pipetují v prvním stojanu SK24.
UDEC jsou označené na obrazovkách a ve zprávách Roche PDM Pooling
Manager a Roche PDM Data Manager.
Archivní plotna
Archivní plotnu (Obrázek 2.4) lze připravit během primární tvorby směsi
a slouží k uložení alikvotního podílu z každé zkumavky se vzorkem dárce
v případě, je nutné provést sekundární tvorbu směsí.
Jestliže archivní plotna není připravená nebo jestliže určitá jamka
na archivní plotně není použitelná, lze sekundární tvorbu směsí
provést přímo ze zkumavek se vzorky dárců.
Pozice jamky, kterou má vzorek na archivní plotně, závisí na počtu
vzorků v běhu a typu prováděné tvorby směsí.
Obrázek 2.4
Archivní plotna
2.4 02/2007, verze 1.0
Primární směsi s 1 vzorkem
Primární směs s 1 vzorkem je směs s jedním vzorkem, která je připravená
pro počáteční testování vzorku. Primární směs s 1 vzorkem se připraví
pipetováním alikvotního podílu z jedné zkumavky se vzorkem dárce do
vlastní S-zkumavky.
Maximální počet zkumavek se vzorkem dárce, které je možné pipetovat do
běhu primární směsi s 1 vzorkem, závisí na testu, použitém pipetoru
a rozměrech zkumavky se vzorkem dárce.
Při běhu primární směsi s 1 vzorkem se 1 ml každého vzorku dárce nasaje
z každé zkumavky první skupiny a napipetován do vlastní S-zkumavky
(Obrázek 2.5).
Test Pipetor Hamilton Microlab
STAR
IVD
Pipetor Hamilton Microlab
STARlet IVD
7ml zkumavky 10ml zkumavky 7ml zkumavky 10ml zkumavky
MPX 216 216 90 90
WNV 264 264 88 88
Obrázek 2.5
Pipetování primárních směsí s 1 vzorkem
Stojan SK24
Nosič zkumavek se vzorky
1 ml
Pozice 32
Pozice 1
dárců s 32 pozicemi
Pipetování
02/2007, verze 1.0 2.5
Jestliže se připravuje archivní plotna, 1 ml každého vzorku dárce se nasaje
z každé zkumavky se vzorkem dárce a poté napipetuje do vlastní jamky na
archivní plotně. Poté se nasaje dalších 135 µl ze stejných zkumavek se
vzorkem dárce a napipetuje se do stejných jamek archivní plotny. Celkový
objem bude v každé jamce 1,135 ml (Obrázek 2.6).
Obrázek 2.6
Pipetování na archivní plotnu pro primární směsi s 1 vzorkem
Archivní plotna
Nosič zkumavek se vzorky
Pozice 32
Pozice 1
1 ml +135 µl
dárců s 32 pozicemi
2.6 02/2007, verze 1.0
Primární směsi s 6 vzorky
Primární směs se 6 vzorky je směs se šesti vzorky, která je připravená pro
počáteční testování vzorku. Primární směs se 6 vzorky je připravená
smísením stejných alikvotních podílů ze šesti zkumavek se vzorkem dárce
do jedné S-zkumavky.
Maximální počet zkumavek se vzorky dárce, které je možné pipetovat v běhu
primární směsi se 6 vzorky, závisí na testu, použitém pipetoru a rozměrech
zkumavky se vzorkem dárce.
Počet vložených vzorků dárce musí být dělitelný 6.
Při běhu primární směsi se 6 vzorky se 1 ml každého vzorku dárce odsaje
z každé zkumavky první skupiny a napipetuje do vlastní jamky na archivní
plotně. Poté se nasaje dalších 700 µl ze stejných zkumavek se vzorky dárců
a napipetuje se do stejných jamek archivní plotny. Celkový přenesený
objem vzorku dárce do příslušné jamky na archivní plotně bude 1,7 ml.
Nakonec se z každé jamky na archivní plotně nasaje 167 µl a napipetuje se
do S-zkumavek, počínaje pozicí 1 prvního stojanu SK24 (Obrázek 2.7).
Tes t
Pipetor Hamilton Microlab STAR
IVD
Pipetor Hamilton Microlab
STARlet IVD
7ml zkumavky 10ml zkumavky 7ml zkumavky 10ml zkumavky
MPX 432 432 216 216
WNV 480 480 264 264
Obrázek 2.7
Pipetování z první skupiny zkumavek se vzorkem dárce pro primární směsi se 6 vzorky
Archivní plotna
Stojan SK24
Nosič zkumavek se vzorky
1 ml +700 µl
167 µl
Pozice 32
Pozice 1
dárců s 32 pozicemi
Pipetování
02/2007, verze 1.0 2.7
Po napipetování první skupiny vzorků dárců se alikvotní podíly z další
skupiny vzorků dárců napipetují do dalších jamek archivní plotny, které
jsou k dispozici a alikvotní podíl z každé z těchto jamek se také pipetuje,
počínaje pozicí 1 prvního stojanu SK24 (Obrázek 2.8).
Tento proces pokračuje, až každá S-zkumavka obsahuje 167 µl smísených
alikvotních podílů šesti vzorků dárce a archivní plotna obsahuje 1,533 ml
alikvotních podílů z každé zkumavky se vzorkem dárce.
Jestliže archivní plotna není připravená, 167 µl alikvotních podílů
se napipetuje přímo do S-zkumavek ze zkumavek se vzorkem dárce.
Obrázek 2.8
Pipetování další skupiny zkumavek se vzorkem dárce pro primární směsi se 6 vzorky
Zařízení COBAS AmpliPrep
Stojan na vzorky
Archivní plotna
Stojan SK24
1 ml +700 µl
167 µl
Nosič zkumavek se vzorky
Pozice 32
Pozice 1
dárců s 32 pozicemi
2.8 02/2007, verze 1.0
Simultánní směsi se 6 vzorky
Primární směsi se 6 vzorky jsou dvě směsi se šesti vzorky, které jsou
připravené pro počáteční testování vzorku. Simultánní směsi se 6 vzorky
se připravují smísením stejných alikvotních podílů ze šesti zkumavek se
vzorkem dárce do každé ze dvou S-zkumavek.
Maximální počet zkumavek se vzorkem dárce, které je možné pipetovat do
běhu simultánní směsi se 6 vzorky, závisí na testu a rozměrech zkumavek
se vzorkem dárce.
Počet vložených vzorků dárce musí být dělitelný 6.
Během běhu simultánní směsi se 6 vzorky se 1 ml každého vzorku dárce
nasaje z každé zkumavky první skupiny a napipetuje do vlastní jamky na
archivní plotně. Poté se nasaje dalších 700 µl ze stejných zkumavek se
vzorkem dárce a napipetuje se do stejných jamek archivní plotny. Celkový
přenesený objem vzorku dárce do příslušné jamky na archivní plotně bude
1,7 ml. Nakonec se z každé jamky na archivní plotně nasaje 334 µl a 167 µl
se napipetuje do každé ze dvou S-zkumavek, počínaje pozicí 1 na každém
stojanu SK24 (Obrázek 2.9).
Tes t
Pipetor Hamilton Microlab STAR
IVD
Pipetor Hamilton Microlab
STARlet IVD
7ml zkumavky 10ml zkumavky 7ml zkumavky 10ml zkumavky
MPX a WNV 396 396 Není k dispozici Není k dispozici
Obrázek 2.9
Pipetování první skupiny zkumavek se vzorkem dárce pro simultánní směsi se 6 vzorky
Archivní plotna
Nosič zkumavek se vzorky
1 ml + 700 µl
167 µl
Pozice 32
Pozice 1
167 µl
Stojan SK24
Stojan SK24
dárců s 32 pozicemi
Pipetování
02/2007, verze 1.0 2.9
Po napipetování první skupiny vzorků dárce se alikvotní podíly z další
skupiny vzorků dárce napipetují do dalších jamek archivní plotny, které
jsou k dispozici a alikvotní podíl z každé z těchto jamek se také pipetuje,
počínaje pozicí 1 obou stojanů SK24.
Tento proces pokračuje, až každá S-zkumavka obsahuje 167 µl smíchaných
alikvotních podílů šesti vzorků dárce a archivní plotna obsahuje 1,466 ml
alikvotních podílů z každé zkumavky se vzorkem dárce.
Jestliže archivní plotna není připravená, 334 µl se aspiruje ze
zkumavek se vzorkem dárce a 167 µl se napipetuje do každé
zS-zkumavek.
2.10 02/2007, verze 1.0
Opakované směsi se 6 vzorky
Opakovaná směs se 6 vzorky je směs šesti vzorků, která slouží k novému
testování vzorků dárce v případě, že primární směs se 6 vzorky měla neplatný
výsledek. Opakovaná směs se 6 vzorky je připravená smísením stejných
alikvotních podílů ze šesti jamek archivní plotny do jedné S-zkumavky.
Opakovaná směs se 6 vzorky musí obsahovat stejné vzorky dárce,
které byly původně smíseny v primární směsi se 6 vzorky.
Maximální množství vzorků, které lze napipetovat do běhu opakované
směsi se 6 vzorky závisí na testu a použitém pipetoru.
Během běhu opakované směsi se 6 vzorky je 167 µl z každého ze šesti
vzorků přeneseno z archivní plotny do S-zkumavky (Obrázek 2.10).
Jestliže archivní plotna není k dispozici nebo jamka archivní plotny
pro daný vzorek dárce není použitelná, lze vzorek aspirovat ze
zkumavky se vzorkem dárce.
Te st Pipetor Hamilton Microlab
STAR
IVD
Pipetor Hamilton Microlab
STARlet IVD
7ml zkumavky 10ml zkumavky 7ml zkumavky 10ml zkumavky
MPX 216 216 216 216
WNV 264 264 264 264
Obrázek 2.10
Pipetování a opakované směsi se 6 vzorky z archivní plotny
Archivní plotna
Stojan SK24
167 µl
Jamky vybrané pro opakovanou tvorbu směsi
Pipetování
02/2007, verze 1.0 2.11
Tvorba směsí pro rozlišení
Rozlišovací směs je směs s jedním vzorkem, vytvořená pro určení
reaktivního vzorku/vzorků v reaktivní primární směsi se šesti vzorky.
Správce laboratoře může také při opětovném testování vzorků z neplatné
primární směsi se 6 vzorky zvolit provedení tvorby směsi pro rozlišení
namísto provedení opakované směsi se 6 vzorky. Směs pro rozlišení se
připraví pipetováním alikvotního podílu z jamky archivní plotny do
vlastní S-zkumavky.
Maximální množství vzorků, které lze napipetovat do běhu tvorby směsi
pro rozlišení závisí na testu a použitém pipetoru.
Během tvorby směsi pro rozlišení se 1 ml vzorku nasaje z jamky na
archivní plotně a napipetuje se do jedné S-zkumavky.
Jestliže archivní plotna není k dispozici nebo jamka archivní plotny
pro daný vzorek dárce není použitelná, lze vzorek nasát ze zkumavky
se vzorkem dárce.
Test
Pipetor Hamilton Microlab
STAR
IVD
Pipetor Hamilton Microlab
STARlet IVD
7ml zkumavky 10ml zkumavky 7ml zkumavky 10ml zkumavky
MPX 36 36 36 36
WNV 44 44 44 44
Obrázek 2.11
Tvorba směsi pro rozlišení z archivní plotny
Archivní plotna
Stojan SK24
1 ml
Jamky vybrané pro tvorbu
směsi pro rozlišení
2.12 02/2007, verze 1.0
Tato stránka je úmyslně ponechána prázdná.
-
1
-
2
-
3
-
4
-
5
-
6
-
7
-
8
-
9
-
10
-
11
-
12
Roche cobas s 201 system Používateľská príručka
- Typ
- Používateľská príručka
Súvisiace články
-
Roche cobas s 201 system Používateľská príručka
-
-
-
-
-
-
-
-